Als Opfer eines von Krangs heimtückischen Experimenten wachte der zuvor bekannte Seymour Gutz auf einem Labortisch auf um erschreckenderweise festzustellen, dass er in einen Mutantenmann verwandelt wurde - ein jämmerliches, tropfendes, ständig verwandelndes Mutier-Monster. Um das Lebenserhaltungssystem zu speisen, benötigt er Ooze (Mutagen) damit sich sein Zustand nicht weiter verschlechtert. Unter Shredders Diensten stehend, begeht er gemeine Straftaten um das Ooze zu erhalten, das sein Körper so dringend benötigt.

Ausgestattet mit einer Mutagen Maschinenpistole hört Mutagen Man nicht auf unerschöpflich die Turtles und ihre Gefolgsleute zu jagen. Also mach dich in die Kanäle auf und verstecke all dein Ooze! Mutagen Man kommt - und du weisst er hat dazu den Mumm in den Knochen!